Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms