Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dpf3P58269 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms