Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TfamP40630 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TfamP40630 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TfamP40630 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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