Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms