Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms