Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms