Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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