Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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