Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1bF6V0H0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms