Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms