Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms