Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spocd1B1ASB6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms