Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbp4A4UUI3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms