Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms