Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms