Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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