Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU7

Ighv1-82, Immunoglobulin heavy variable 1-82 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ighv1-82A0A0G2JEU7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms