Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp1a4Q9WV27 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms