Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms