Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ChmQ9QXG2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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