Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Higd1aQ9JLR9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Higd1aQ9JLR9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Higd1aQ9JLR9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd1aQ9JLR9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Higd1aQ9JLR9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Higd1aQ9JLR9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
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Higd1aQ9JLR9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Higd1aQ9JLR9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Higd1aQ9JLR9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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Higd1aQ9JLR9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1aQ9JLR9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Higd1aQ9JLR9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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