Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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