Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pgpep1Q9ESW8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms