Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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