Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc3Q9D114 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms