Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Wdr55Q9CX97 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Wdr55Q9CX97 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Wdr55Q9CX97 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Wdr55Q9CX97 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Wdr55Q9CX97 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Wdr55Q9CX97 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr55Q9CX97 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Wdr55Q9CX97 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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