Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9CRC3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms