Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms