Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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