Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms