Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TwnkQ8CIW5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TwnkQ8CIW5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TwnkQ8CIW5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TwnkQ8CIW5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TwnkQ8CIW5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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