Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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