Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms