Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ckap2lQ7TS74 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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