Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms