Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PatjQ63ZW7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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