Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ss18Q62280 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18Q62280 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ss18Q62280 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ss18Q62280 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ss18Q62280 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ss18Q62280 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ss18Q62280 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ss18Q62280 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18Q62280 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18Q62280 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18Q62280 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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