Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BcanQ61361 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BcanQ61361 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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