Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tbc1d1Q60949 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms