Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms