Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms