Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Acsf3Q3URE1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Acsf3Q3URE1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Acsf3Q3URE1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Acsf3Q3URE1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Acsf3Q3URE1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms