Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms