Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccndbp1Q3TVC7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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