Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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TAF1AQ15573 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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