Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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