Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn2Q08093 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn2Q08093 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn2Q08093 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn2Q08093 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn2Q08093 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn2Q08093 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Cnn2Q08093 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cnn2Q08093 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cnn2Q08093 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cnn2Q08093 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cnn2Q08093 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms