Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms