Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms