Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms